Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CBX3Q13185 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CBX3Q13185 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CBX3Q13185 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CBX3Q13185 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CBX3Q13185 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX3Q13185 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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