Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSME1Q06323 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSME1Q06323 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSME1Q06323 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSME1Q06323 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSME1Q06323 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSME1Q06323 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PSME1Q06323 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PSME1Q06323 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PSME1Q06323 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms