Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms