Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP7AQ04656 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms