Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPEQ02224 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms