Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms