Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUCB2P80303 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms