Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX1P78337 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITX1P78337 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITX1P78337 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PITX1P78337 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX1P78337 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX1P78337 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITX1P78337 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms