Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN1P60606 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms