Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL2P60520 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL2P60520 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL2P60520 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL2P60520 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL2P60520 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL2P60520 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms