Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DEFA3P59666 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DEFA3P59666 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms