Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMDP57764 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms