Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP1B3P54709 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms