Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNB3P54284 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms