Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATN1P54259 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms