Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NKX2-5P52952 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX2-5P52952 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms