Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFNA3P52797 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFNA3P52797 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms