Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRCA2P51587 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms