Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIA4P48058 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms