Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.38□□□□□ -2.19
UFE1P41834 RPL26AYLR344W 384 nt1.38□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YPL182CYPL182C 384 nt1.38□□□□□ -2.19
UFE1P41834 OSH6YKR003W 1347 nt1.38□□□□□ -2.19
UFE1P41834 CDC25YLR310C 4770 nt1.37□□□□□ -2.19
UFE1P41834 MSC6YOR354C 2079 nt1.37□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.37□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YAR047CYAR047C 321 nt1.37□□□□□ -2.19
UFE1P41834 BSC3YLR465C 309 nt1.37□□□□□ -2.19
UFE1P41834 PCF11YDR228C 1881 nt1.37□□□□□ -2.19
UFE1P41834 MMS22YLR320W 4365 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YDR008CYDR008C 351 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YAP6YDR259C 1152 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 TIM13YGR181W 318 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 SWI5YDR146C 2130 nt1.36□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.35□□□□□ -2.19
UFE1P41834 TRX1YLR043C 312 nt1.35□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.35□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YGR250CYGR250C 2346 nt1.34□□□□□ -2.19
UFE1P41834 YLR334CYLR334C 381 nt1.34□□□□□ -2.19
UFE1P41834 ISF1YMR081C 1017 nt1.34□□□□□ -2.19
UFE1P41834 RPL9BYNL067W 576 nt1.34□□□□□ -2.19
UFE1P41834 HDA3YPR179C 1968 nt1.34□□□□□ -2.2
UFE1P41834 TBS1YBR150C 3285 nt1.34□□□□□ -2.2
UFE1P41834 IRE1YHR079C 3348 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 SPC98YNL126W 2541 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 SEC21YNL287W 2808 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 HMRA1YCR097W 381 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 ATG31YDR022C 591 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YKL083WYKL083W 615 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YML003WYML003W 873 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 PBY1YBR094W 2262 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 PXA2YKL188C 2562 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 NOP53YPL146C 1368 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 KCS1YDR017C 3153 nt1.33□□□□□ -2.2
UFE1P41834 SEC63YOR254C 1992 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 IRR1YIL026C 3453 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 SRP14YDL092W 441 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 RPS27AYKL156W 249 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 FMP23YBR047W 528 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YPR012WYPR012W 255 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 RLM1YPL089C 2031 nt1.32□□□□□ -2.2
UFE1P41834 CDC36YDL165W 576 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 ABM1YJR108W 372 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YLR140WYLR140W 327 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YPL261CYPL261C 309 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 PIK1YNL267W 3201 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 ZRG17YNR039C 1818 nt1.31□□□□□ -2.2
UFE1P41834 CTR9YOL145C 3234 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 LAA1YJL207C 6045 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YHL041WYHL041W 450 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 HIT1YJR055W 495 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YOR121CYOR121C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 AIM9YER080W 1884 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 SKI3YPR189W 4299 nt1.3□□□□□ -2.2
UFE1P41834 ADR1YDR216W 3972 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 IML1YJR138W 4755 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 snR56snR56 88 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 CYC7YEL039C 342 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YGR265WYGR265W 411 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YBL073WYBL073W 312 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YOP1YPR028W 543 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 FRK1YPL141C 2598 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 MSH5YDL154W 2706 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 PIP2YOR363C 2991 nt1.29□□□□□ -2.2
UFE1P41834 HHT1YBR010W 411 nt1.28□□□□□ -2.2
UFE1P41834 YPL229WYPL229W 621 nt1.28□□□□□ -2.2
UFE1P41834 LYS14YDR034C 2373 nt1.27□□□□□ -2.21
UFE1P41834 MAK10YEL053C 2202 nt1.27□□□□□ -2.21
UFE1P41834 STF2YGR008C 255 nt1.27□□□□□ -2.21
UFE1P41834 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.27□□□□□ -2.21
UFE1P41834 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.27□□□□□ -2.21
UFE1P41834 HUG1YML058W-A 207 nt1.27□□□□□ -2.21
UFE1P41834 TTI1YKL033W 3117 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 PAC1YOR269W 1485 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 RTR1YER139C 681 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 UPS1YLR193C 528 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 SWI6YLR182W 2412 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 EFR3YMR212C 2349 nt1.26□□□□□ -2.21
UFE1P41834 HMI1YOL095C 2121 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 SAC3YDR159W 3906 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 TUS1YLR425W 3924 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 GIM4YEL003W 336 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 YIL059CYIL059C 366 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 IRC23YOR044W 474 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 YBR012CYBR012C 420 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 ZIP1YDR285W 2628 nt1.25□□□□□ -2.21
UFE1P41834 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.24□□□□□ -2.21
UFE1P41834 RFX1YLR176C 2436 nt1.24□□□□□ -2.21
UFE1P41834 YOR029WYOR029W 336 nt1.23□□□□□ -2.21
UFE1P41834 RPL33BYOR234C 324 nt1.23□□□□□ -2.21
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