Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP8P40818 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP8P40818 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP8P40818 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP8P40818 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP8P40818 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms