Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.11□□□□□ -2.07
VFA1P40080 FKS1YLR342W 5631 nt2.11□□□□□ -2.07
VFA1P40080 CSF1YLR087C 8877 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 SYH1YPL105C 2550 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 TOF1YNL273W 3717 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 RTT101YJL047C 2529 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 NPC2YDL046W 522 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 MCM22YJR135C 720 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YOP1YPR028W 543 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 IST2YBR086C 2841 nt2.1□□□□□ -2.07
VFA1P40080 STH1YIL126W 4080 nt2.09□□□□□ -2.07
VFA1P40080 PUT3YKL015W 2940 nt2.09□□□□□ -2.07
VFA1P40080 SIR4YDR227W 4077 nt2.09□□□□□ -2.07
VFA1P40080 RPL37BYDR500C 267 nt2.09□□□□□ -2.07
VFA1P40080 PCC1YKR095W-A 267 nt2.09□□□□□ -2.07
VFA1P40080 YOR282WYOR282W 321 nt2.09□□□□□ -2.07
VFA1P40080 RFX1YLR176C 2436 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 MUK1YPL070W 1839 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 MVP1YMR004W 1536 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 snR51snR51 107 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YCL046WYCL046W 324 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 LYS14YDR034C 2373 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 BNI1YNL271C 5862 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 ARP7YPR034W 1434 nt2.08□□□□□ -2.08
VFA1P40080 NAM7YMR080C 2916 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YIL102CYIL102C 306 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YLR255CYLR255C 354 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 TFC8YPL007C 1767 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 DBP6YNR038W 1890 nt2.07□□□□□ -2.08
VFA1P40080 ZRG17YNR039C 1818 nt2.06□□□□□ -2.08
VFA1P40080 CFT2YLR115W 2580 nt2.05□□□□□ -2.08
VFA1P40080 COS111YBR203W 2775 nt2.05□□□□□ -2.08
VFA1P40080 CHC1YGL206C 4962 nt2.05□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YDR426CYDR426C 378 nt2.05□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.05□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.04□□□□□ -2.08
VFA1P40080 SLY1YDR189W 2001 nt2.04□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YGR265WYGR265W 411 nt2.04□□□□□ -2.08
VFA1P40080 TRX1YLR043C 312 nt2.04□□□□□ -2.08
VFA1P40080 INP2YMR163C 2118 nt2.04□□□□□ -2.08
VFA1P40080 PET309YLR067C 2898 nt2.04□□□□□ -2.08
VFA1P40080 HMRA2YCR096C 360 nt2.03□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YDR366CYDR366C 399 nt2.03□□□□□ -2.08
VFA1P40080 YPR063CYPR063C 423 nt2.03□□□□□ -2.08
VFA1P40080 TOR2YKL203C 7425 nt2.03□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.02□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.02□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.02□□□□□ -2.09
VFA1P40080 BUD2YKL092C 3315 nt2.01□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YDR344CYDR344C 444 nt2.01□□□□□ -2.09
VFA1P40080 ALG13YGL047W 609 nt2.01□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.01□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YIL032CYIL032C 357 nt2.01□□□□□ -2.09
VFA1P40080 MSC6YOR354C 2079 nt2□□□□□ -2.09
VFA1P40080 CAT2YML042W 2013 nt2□□□□□ -2.09
VFA1P40080 snR8snR8 190 nt2□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2□□□□□ -2.09
VFA1P40080 RPB10YOR210W 213 nt2□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YCL023CYCL023C 348 nt2□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YLL032CYLL032C 2478 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 TDA9YML081W 3756 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 HCS1YKL017C 2052 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 MSH5YDL154W 2706 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 MAK10YEL053C 2202 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YGR250CYGR250C 2346 nt1.99□□□□□ -2.09
VFA1P40080 ZIP1YDR285W 2628 nt1.98□□□□□ -2.09
VFA1P40080 snR72snR72 98 nt1.98□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YHL042WYHL042W 453 nt1.98□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YJL135WYJL135W 318 nt1.98□□□□□ -2.09
VFA1P40080 ATG11YPR049C 3537 nt1.98□□□□□ -2.09
VFA1P40080 PEP1YBL017C 4740 nt1.98□□□□□ -2.09
VFA1P40080 RTP1YMR185W 2946 nt1.97□□□□□ -2.09
VFA1P40080 HSH155YMR288W 2916 nt1.97□□□□□ -2.09
VFA1P40080 DCP2YNL118C 2913 nt1.97□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YGR069WYGR069W 336 nt1.97□□□□□ -2.09
VFA1P40080 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.97□□□□□ -2.09
VFA1P40080 CTR9YOL145C 3234 nt1.97□□□□□ -2.09
VFA1P40080 MDM20YOL076W 2391 nt1.96□□□□□ -2.09
VFA1P40080 COG8YML071C 1824 nt1.96□□□□□ -2.1
VFA1P40080 YJL015CYJL015C 285 nt1.96□□□□□ -2.1
VFA1P40080 FAB1YFR019W 6837 nt1.96□□□□□ -2.1
VFA1P40080 HER1YOR227W 3741 nt1.96□□□□□ -2.1
VFA1P40080 USO1YDL058W 5373 nt1.95□□□□□ -2.1
VFA1P40080 NIP100YPL174C 2607 nt1.95□□□□□ -2.1
VFA1P40080 RAD61YDR014W 1944 nt1.95□□□□□ -2.1
VFA1P40080 ENV11YGR071C 2583 nt1.95□□□□□ -2.1
VFA1P40080 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
VFA1P40080 RLM1YPL089C 2031 nt1.95□□□□□ -2.1
VFA1P40080 HIR3YJR140C 4947 nt1.94□□□□□ -2.1
VFA1P40080 OST1YJL002C 1431 nt1.94□□□□□ -2.1
VFA1P40080 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.94□□□□□ -2.1
VFA1P40080 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.94□□□□□ -2.1
VFA1P40080 SCW11YGL028C 1629 nt1.93□□□□□ -2.1
VFA1P40080 YOL160WYOL160W 342 nt1.93□□□□□ -2.1
VFA1P40080 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.93□□□□□ -2.1
VFA1P40080 AGC1YPR021C 2709 nt1.92□□□□□ -2.1
VFA1P40080 IRE1YHR079C 3348 nt1.92□□□□□ -2.1
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