Protein–RNA interactions for Protein: P38192

RRT1, Regulator of rDNA transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1P38192 MXR1YER042W 555 nt0.56□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.56□□□□□ -2.32
RRT1P38192 PXA2YKL188C 2562 nt0.56□□□□□ -2.32
RRT1P38192 LYS14YDR034C 2373 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 SPO23YBR250W 1572 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YDR008CYDR008C 351 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YDR521WYDR521W 336 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 SPO13YHR014W 876 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 ECM9YKR004C 1134 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 SDH2YLL041C 801 nt0.55□□□□□ -2.32
RRT1P38192 DOP1YDR141C 5097 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YAR009CYAR009C 3591 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 SCEIQ0160 708 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 NBL1YHR199C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YJR079WYJR079W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YOR199WYOR199W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 SLM6YBR266C 453 nt0.54□□□□□ -2.32
RRT1P38192 PDE2YOR360C 1581 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT1P38192 YDL196WYDL196W 330 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT1P38192 HIT1YJR055W 495 nt0.53□□□□□ -2.32
RRT1P38192 AFR1YDR085C 1863 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 PPN1YDR452W 2025 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YLR252WYLR252W 306 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 IPP1YBR011C 864 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 SLD3YGL113W 2007 nt0.52□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YDL187CYDL187C 330 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 AFB1YLR040C 675 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 UPS1YLR193C 528 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 MMS4YBR098W 2076 nt0.51□□□□□ -2.33
RRT1P38192 SWI6YLR182W 2412 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 SWF1YDR126W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YJR087WYJR087W 351 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 GMC2YLR445W 567 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 IES4YOR189W 351 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YOR248WYOR248W 303 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 LCD1YDR499W 2244 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 SLY1YDR189W 2001 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 RKR1YMR247C 4689 nt0.5□□□□□ -2.33
RRT1P38192 OCA6YDR067C 675 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT1P38192 SLX9YGR081C 633 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT1P38192 ALY2YJL084C 3141 nt0.49□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YDL073WYDL073W 2955 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT1P38192 ALG13YGL047W 609 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YLL032CYLL032C 2478 nt0.48□□□□□ -2.33
RRT1P38192 ENV11YGR071C 2583 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT1P38192 RRT1YBL048W 312 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YOR029WYOR029W 336 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT1P38192 WAR1YML076C 2835 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT1P38192 UTP10YJL109C 5310 nt0.47□□□□□ -2.33
RRT1P38192 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YLR198CYLR198C 360 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YOL029CYOL029C 606 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT1P38192 DBP6YNR038W 1890 nt0.46□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YIL059CYIL059C 366 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT1P38192 ILM1YJR118C 612 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT1P38192 MRPL31YKL138C 396 nt0.45□□□□□ -2.34
RRT1P38192 SLI15YBR156C 2097 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 ECM12YHR021W-A 456 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 DCP1YOL149W 696 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YPR039WYPR039W 336 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YPR153WYPR153W 423 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 RFX1YLR176C 2436 nt0.44□□□□□ -2.34
RRT1P38192 COG4YPR105C 2586 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 MET32YDR253C 576 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 SPO11YHL022C 1197 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 RPL38YLR325C 237 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 GRX5YPL059W 453 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YMR160WYMR160W 2451 nt0.43□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YML002WYML002W 2214 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 OST1YJL002C 1431 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 NPC2YDL046W 522 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YGR042WYGR042W 816 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 URM1YIL008W 300 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 YIL029CYIL029C 429 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 INA22YIR024C 651 nt0.42□□□□□ -2.34
RRT1P38192 IRC16YPR038W 360 nt0.42□□□□□ -2.34
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