Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms