Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5C1P36542 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms