Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM23P36406 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms