Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD13P35453 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms