Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRKCHP24723 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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