Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms