Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms