Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms