Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4AP20648 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms