Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PVALBP20472 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms