Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DPA1P20036 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DPA1P20036 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms