Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYL1P12980 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LYL1P12980 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms