Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms