Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CETPP11597 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CETPP11597 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CETPP11597 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CETPP11597 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CETPP11597 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CETPP11597 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CETPP11597 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CETPP11597 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CETPP11597 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CETPP11597 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CETPP11597 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CETPP11597 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CETPP11597 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CETPP11597 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CETPP11597 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CETPP11597 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CETPP11597 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CETPP11597 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms