Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC175P0C221 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms