Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA1P01562 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA1P01562 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms