Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24AO95486 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24AO95486 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms