Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN15O75808 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN15O75808 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms