Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPFIA3O75145 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms