Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTATSF1O43719 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms