Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCP110O43303 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCP110O43303 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCP110O43303 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCP110O43303 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCP110O43303 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCP110O43303 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms