Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIF3BO15066 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3BO15066 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3BO15066 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms