Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIP1O00291 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIP1O00291 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIP1O00291 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIP1O00291 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIP1O00291 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms