Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNAP23O00161 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNAP23O00161 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms