Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C1D1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C1D1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C1D1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C1D1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C1D1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C1D1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C1D1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C1D1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C1D1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C1D1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C1D1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms