Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BQV1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BQV1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BQV1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H3BQV1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BQV1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BQV1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BQV1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BQV1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms