Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms